Esta población nace por el impulso del Monasterio de Santa María, levantado por el afán de los monarcas leoneses de colonizar extensos territorios yermos. Este monasterio se originó sobre otra comunidad establecida en el siglo X bajo la advocación de Santiago. La tradición atribuye su fundación a San Atilano.

Con la protección del rey Alfonso VII y la eficaz gestión de los monjes cistercienses, el Monasterio creará un dominio territorial sobre las tierras de La Lampreana y de Campos. Sus sistemas de explotación a base de granjas y regadíos, sus modelos constructivos que renovaron el arte románico y su forma de organización administrativa tendrán gran influencia en la sociedad medieval. Su dominio alcanzó gran parte de la provincia, llegando incluso a localidades portuguesas de Tras-os-Montes. En 1618 Juan Cascajo fundó la Capellanía del Cristo del Amparo en Granja.

El Concejo y los vecinos pagaban anualmente al Monasterio 390 fanegas de pan terciado, 70 gallinas y 900 reales por tres foros que les permitían el aprovechamiento de sus bienes rústicos. La Desamortización de las propiedades de los monjes de San Bernardo y la desidia posterior pusieron fin al esplendor de este cenobio, que ahora está siendo recuperado con un serio proyecto de consolidación.